dna 连接酶主要按照来源和作用特点划分成两大类,分别是大肠杆菌来源的 dna 连接酶和 T4 噬菌体来源的 dna 连接酶,这两种是基因工程实验当中最常使用的类型,二者虽然都可以催化 dna 片段之间形成磷酸二酯键,但是能量供体,适配的末端类型,实验适用场景存在明显差别,dna 连接酶的核心功能都是修复 dna 链上相邻核苷酸之间的缺口,把两段 dna 片段共价连接,在 dna 复制修复以及重组 dna 技术里面承担关键作用,不同种类的 dna 连接酶进化来源不一样,所以酶的催化特性出现分化,实验人员需要根据 dna 末端是黏性末端还是平末端来挑选对应的 dna 连接酶种类。
主要种类基础对比表
| 种类 | 来源 | 能量供体 | 可连接末端 |
|---|---|---|---|
| 大肠杆菌 dna 连接酶 | 大肠杆菌 | NAD+ | 优先黏性末端 |
| T4 dna 连接酶 | T4 噬菌体 | ATP | 黏性末端和平末端 |
各类 dna 连接酶详细特点
1 大肠杆菌 dna 连接酶
该酶依靠烟酰胺腺嘌呤二核苷酸也就是 NAD + 提供催化所需能量,它的天然生理作用是在大肠杆菌自身 dna 复制和 dna 损伤修复的时候,连接后随链冈崎片段之间的缺口,这个种类的 dna 连接酶对平末端连接效率很低,一般不推荐用于平末端的重组克隆实验,在原核生物体内属于内源酶,稳定性和温度适应特性偏向原核生物生理温度。
2 T4 dna 连接酶
该酶由 T4 噬菌体基因编码,催化反应依靠 ATP 水解释放能量,它是基因工程应用最广泛的 dna 连接酶种类,既能够高效连接互补的黏性末端,也可以催化平末端 dna 片段连接,只是平末端连接反应速度相对更慢,需要提高酶量并且延长反应时间,除了常规片段连接,它还可以用于修复单链缺口,是分子克隆,载体构建,基因拼接实验的核心工具酶。
补充拓展种类说明
除上面两种主流实验用酶,生物体内还存在其他亚型 dna 连接酶,真核生物细胞内部存在多种 dna 连接酶同工酶,比如 dna 连接酶 I 主要参与细胞核 dna 复制,连接冈崎片段,dna 连接酶 III 参与碱基切除修复,dna 连接酶 IV 主要参与非同源末端连接修复,这类真核内源 dna 连接酶种类一般不作为体外基因工程工具酶,更多研究方向集中在细胞 dna 损伤修复通路。
选择 dna 连接酶种类的实操要点
如果实验只需要连接黏性末端,可以选择大肠杆菌 dna 连接酶,成本相对更低,如果实验需要连接平末端,必须选用 T4 dna 连接酶,反应体系里面需要保证 ATP 稳定,避免 ATP 降解造成酶活性下降,反应温度通常设置在 16 摄氏度左右,低温可以提升末端配对稳定性,提升连接成功率。
【常见问题】
问题 1 T4 dna 连接酶种类能不能连接平末端
回答 1 T4 dna 连接酶种类可以连接平末端,这也是它和大肠杆菌 dna 连接酶种类最核心的区别,只是平末端连接效率低于黏性末端,需要增加酶用量和延长孵育时间。
问题 2 大肠杆菌 dna 连接酶种类的能量供体是什么
回答 2 大肠杆菌 dna 连接酶种类的能量供体是 NAD+,和 T4 dna 连接酶种类依靠 ATP 供能的机制不一样,这个供体差异会影响体外反应体系的配制。
问题 3 真核生物 dna 连接酶种类主要生理作用是什么
回答 3 真核生物 dna 连接酶种类主要生理作用是参与细胞核 dna 复制以及各类 dna 损伤修复,不同亚型 dna 连接酶种类分工不同,分别负责冈崎片段连接和断裂 dna 修复。
【免责申明】
本文内容为高中生物与分子生物学基础知识科普,仅用于学习备考参考,不替代正式教材与专业实验指导,开展体外酶促实验请参照正规实验手册操作规范。


